2022年12月29日，我院病理科、生物样本库、胸外科团队与山西医科大学崔永萍教授团队、中国医学科学院肿瘤医院刘芝华/焦宇辰团队、深圳湾实验室詹启敏院士团队合作，在国际顶级肿瘤期刊Cancer Cell（IF=38.585）上发表了文章《Integrated Multi-omics Profiling Yields a Clinically-Relevant Molecular Classification for Esophageal Squamous Cell Carcinoma》，这是国际上首个基于多组学数据对食管鳞癌进行分子分型的研究。我院病理科郗彦凤主任、徐恩伟博士、肿瘤生物样本库孙瑞芳主任、孟永胜、刘美林，胸外科魏书庆主任、杨斌主任、郭石平主任、庄晓飞主任等均参与了本项研究，其中病理科徐恩伟为本文共同第一作者。

　　本研究纳入155例食管鳞癌患者配对样本进行了全基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组数据层面的全面整合分析；利用多组学分析首次将食管鳞癌分为细胞周期通路激活型（CCA）、NRF2通路激活型（NRFA）、免疫抑制型（IS）和免疫调节型（IM）。CCA亚型体现在细胞周期检查点基因的变异，而NRFA亚型则有NRF2通路基因的激活。CCA和NRFA亚型患者均具有CpG岛甲基化表型（E-CIMP+），并与淋巴结转移和临床分期相关。IS和IM亚型是免疫细胞高浸润型，但肿瘤组织浸润的免疫细胞类型不同。研究者进一步利用43例接受PD-1抗体单药治疗队列研究，发现IM亚型对免疫检查点阻断疗法（ICB）有更好的治疗响应，并基于该队列ESCC组织多组学数据开发了识别IM亚型患者的分子特征分类器。体现了基于多组学数据分子分型的临床价值。这是国际上首次基于多组学数据的食管鳞癌分类标准，并为每个亚型寻找了潜在的治疗靶标和/或诊断标志物，为后续开展针对食管鳞癌各亚型的药物研发及临床试验研究，制定出针对不同亚型食管鳞癌的治疗策略，实现食管鳞癌患者的精准治疗提供了理论依据和支持。

　　近年来，我院病理科、生物样本库、胸外科等积极开展对外科研合作，充分发挥自己临床优势，参与了多项重大科研项目的研究，先后完成了全球最大的508例食管鳞癌全基因组学研究（2020年Cell Research）、94例的食管鳞癌蛋白组及磷酸化蛋白质组学研究（2021年STTT）、528例食管鳞癌的基因结构变异研究（2022年Nature communications）。本研究成果的发表再次体现了我院科研实力的显著提升，以及对外科研合作水平的持续提高。